SyMAP Syntenyブラウザ

SyMAP(Syを nteny Mの appingとnalysisのPの rogram)V4.0は、 ゲノムのシンテニーアラインメントを識別し、表示するための自動化されたシステムです。ゲノムは、配列染色体(擬似分子)、ドラフト配列コンティグ、またはFPC物理マップ(BAC末端またはマーカー配列を有する)によって表され得る。
出版物またはウェブサイトでこのページの結果を使用する場合は、参考にしてください:

SyMAPはユジコシおよび単子葉植物の分析のために開発されたが、哺乳類、細菌および真菌ゲノムについても試験されている。Javaファイルをダウンロードする必要があるため、最初にアプレットのロードが遅くなることに注意してください。アプレットにメモリが不足している場合は、次 の手順を実行します。

注記:Javaバージョン7では、セキュリティが強化されています。Javaがアプレットにアクセスできない場合は、セキュリティ設定を変更する必要があります。SyMAPは署名付きのセキュアなアプレットです。

注:すべてのアライメントは2014年以前に行われました。

メンテナンス:SyMAPデータベースは現在、システムをアップグレードしているため動作していません。

SyMAP v4.0でシンセシスを表示するグループを選択する
ポワエ トウモロコシ、ライス、ブラキポディウム、ソルガム
ワカメ シロイヌナズナ、メディカゴ、大豆、ポプラ、ブドウ
バラ科、Curcurbiteae アップル、ピーチ、キュウリ
すべてのアライメントは、デフォルトのSyMAPパラメータを使用して計算されました。
ゲノムは解析前にマスクされなかった。